Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms