Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Rnpc3Q3UZ01 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Rnpc3Q3UZ01 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms