Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms