Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sf3b2Q3UJB0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sf3b2Q3UJB0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms