Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms