Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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