Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Rnf149Q3U2C5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnf149Q3U2C5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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