Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms