Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Srsf6Q3TWW8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms