Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc13Q3TIR1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms