Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hddc2Q3SXD3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hddc2Q3SXD3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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