Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Traf3ip1Q149C2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Traf3ip1Q149C2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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