Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Perm1Q149B8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Perm1Q149B8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Perm1Q149B8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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