Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms