Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TrioQ0KL02 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms