Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Calb2Q08331 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms