Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms