Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cntn3Q07409 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cntn3Q07409 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms