Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cab39Q06138 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms