Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms