Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kcnb1Q03717 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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Kcnb1Q03717 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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