Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Thbs2Q03350 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms