Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cacna1cQ01815 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms