Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
EgfrQ01279 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
EgfrQ01279 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms