Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gfra1P97785 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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