Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms