Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gbx1P82976 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms