Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkn1P70268 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn1P70268 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn1P70268 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn1P70268 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkn1P70268 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms