Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NfixP70257 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NfixP70257 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NfixP70257 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms