Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Hoxd13P70217 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd13P70217 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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