Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UbdP63072 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UbdP63072 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UbdP63072 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UbdP63072 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UbdP63072 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
UbdP63072 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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UbdP63072 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UbdP63072 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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