Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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