Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pik3c3-201ENSMUST00000091978 2998 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm45769-201ENSMUST00000204588 1828 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Zfp384-203ENSMUST00000084275 2829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Atp5eP56382 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms