Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp1P55194 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sh3bp1P55194 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms