Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TspoP50637 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TspoP50637 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms