Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hoxc13P50207 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxc13P50207 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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