Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rfx1P48377 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rfx1P48377 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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