Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax9P47242 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms