Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkn1bP46414 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cdkn1bP46414 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms