Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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LtbP41155 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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LtbP41155 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LtbP41155 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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