Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms