Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms