Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms