Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms