Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hoxb1P17919 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxb1P17919 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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