Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcnaP17918 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcnaP17918 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcnaP17918 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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PcnaP17918 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PcnaP17918 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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