Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
Vpreb1P13372 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb1P13372 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms