Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nr4a1P12813 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nr4a1P12813 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms