Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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