Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfdp1O88271 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms